La misión de la Fundació es contribuir a la mejora de la salud y el bienestar de las personas fomentando, dando soporte y coordinando la investigación y la innovación de los centros de la Orden Hospitalaria de San Juan de Dios de acuerdo con sus valores, buscando la eficencia y el trabajo en red, teniendo en todo momento presente nuestro compromiso ético y nuestra orientación científica y social.