Das Forschungsinstitut für Limnologie, Mondsee der Universität Innsbruck betreibt evolutionsökologische Forschung an Binnengewässern. Das übergeordnete Forschungsziel ist es, die evolutionären Anpassungen aquatischer Organismen und die Konsequenzen auf Ökosystemebene unter dem Einfluß des Klimawandels und zunehmender menschlicher Nutzung zu verstehen. Dabei reicht der Fokus von Bakterien bis zu Fischen um Muster und Prozesse ökologischer und evolutionsbiologischer Relevanz zu untersuchen. Obwohl sich das Forschungsinstitut vor allem der Grundlagenforschung widmet, werden Fragen der angewandten Limnologie ebenfalls bearbeitet.