משרד הפנים מהווה את חוד החנית הממשלתית בקידום ויישום המדיניות בכל הקשור לפיקוח ובקרה על השלטון המקומי והרשויות המקומיות בישראל, כמו גם לפיתוחן ולחיזוקן, וזאת במטרה להוביל לשינוי משמעותי באיכות החיים של תושבי המדינה ושיפור השירות הניתן להם. כנגזרת מכך, פועל המשרד לצמצום פערים והתרת חסמים, באמצעות התייעלות כלכלית, קידום צדק חלוקתי והעצמת ההון האנושי, בדגש על הרשויות המוחלשות. בשנים האחרונות, מוביל המשרד שורה של רפורמות ומהלכים למען חיזוק השלטון המקומי וצמצום הפערים בין הרשויות – הקמת הקרן לצמצום פערים; קידום החלטות ממשלה ממוקדות רשויות מוחלשות; הובלת הרפורמה ברישוי עסקים; קידום תפיסת האזוריות ושיתופי פעולה אזוריים בין רשויות מקומיות; הקמה וביסוס של הוועדות הגאוגרפיות הקבועות לצדק חלוקתי; שיפור משמעותי במידת המוכנות של הרשויות לשעת חירום; קידום תהליכי פיתוח כלכליים וארגוניים על ידי עידוד חדשנות ויזמות בשלטון המקומי; פיתוח מודל תכנית ההמראה; הנחת תשתית ופיתוח חדשנות ודיגיטציה ברשויות המקומיות ועוד. כמו כן, משקיע המשרד מאמץ רב בחיזוק ובהשבחת ההון האנושי בשלטון המקומי, באמצעות מהלכים להתייעלות ופיתוח ארגוני, תכניות עתודה חדשניות כגון תכנית צוערים לשלטון המקומי, תכנית משפיעים. יתירה מכך, המשרד פועל לגיבוש רפורמה בתאגידים העירוניים; חיזוק האגף לעדות לא יהודיות ועוד שורה ארוכה של מהלכים.