Órgano público que realiza la función de impartir justicia en nombre del Estado de Honduras, por magistrados y jueces independiente. El Poder Judicial se integra por una Corte Suprema de Justicia, por las Corte de Apelaciones, los Juzgados, el Tribunal de Justicia Electoral y los Tribunales con competencia exclusiva en las ZEDES. La Corte Suprema de Justicia actualmente está organizada en salas que son: la Sala de lo Constitucional, que tutela las garantías constitucionales; y la Sala de lo Penal, Sala de lo Civil y la Sala de lo Laboral - Contencioso Administrativo, que conocen de la casación. Se cuenta con distintas Cortes de Apelaciones y Juzgado a nivel nacional; divididos por zonas territoriales y materiales.