Fue creada como UNIVERSIDAD PRIVADA DE MOQUEGUA por ley Nº 25153 el 23 de diciembre de 1989. El 03 de abril del 2001 la Comisión Organizadora presidida por el Dr. Miguel Fuentes Chávez, asumió con entrega y convicción el gran compromiso de institucionalizar la universidad, la misma que se hizo efectiva en un lapso de 13 meses. Por eso el 28 de mayo del 2002 se consiguió el gran sueño de su institucionalización mediante resolución Nº 389-2002-ANR y como fruto de esta resolución el 13 de noviembre del 2002 se promulgó el primer estatuto de la Universidad y posteriormente el 30 de diciembre del mismo año, fueron elegidos el Rector y Vicerrector en un ambiente democrático y en estricto cumplimiento de la ley universitaria y del mencionado estatuto, actos que garantizan la autonomía y credibilidad de la Universidad “José Carlos Mariátegui". La Universidad se dedica plenamente a la Investigación Científica, al estudio constante, la educación superior integral, a la formación académica profesional y a la difusión de la cultura. Con visión de constituirse en una de las mejores universidades peruanas, viene ampliando su infraestructura tanto en Moquegua como en la sede Ilo, se viene equipando con tecnología de punta, ofrece Diplomados, Segundas Especialidades, Maestrías, Centro Pre Universitario, Centro de Cómputo y Sistemas, y el Centro de Idiomas; además cuenta con oficinas de enlace en diversas regiones del Perú.