L’Università degli Studi di Foggia nasce il 5 agosto 1999 portando a compimento un processo partito negli anni 90 con l’istituzione di numerosi corsi di studio dell’Università di Bari. Nasce, quindi, in virtù di un processo di ‘gemmazione’ per il decongestionamento dell’Ateneo barese. L’Università di Foggia, giunta al suo primo decennio di vita, è divenuta ormai una realtà consolidata nel panorama nazionale del sistema della formazione superiore e della ricerca.
È attualmente sede dell'HR Excellence in Resarch. Titolo che viene attribuito alle Università europee che abbiamo sistematizzato processi trasparenti per la valorizzazione della ricerca mediante l'adozione effettiva della carta europea dei ricercatori e del codice di condotta per il reclutamento dei ricercatori.
L'Università di Foggia organizza anche corsi di alta formazione e di formazione mediante la ricerca. La ricerca prodotta è di frontiera ma anche applicata con una particolare attenzione al trasferimento di tecnologia.