ПАО «БАЛТИНВЕСТБАНК» создан в декабре 1994 года и зарегистрирован как ОАО КБ «БАЛТОНЭКСИМ БАНК». В 1996 году банк стал членом S.W.I.F.T., в 1997 году получил статус дилера в Российской Торговой Системе. В 1998 году Балтинвестбанк открыл первый филиал в г. Выборг (Ленинградская область), в 1999 году – второй филиал в Архангельске.
В 2003 году БАЛТОНЭКСИМ БАНК был переименован в ОАО «БАЛТИНВЕСТБАНК», открыл первый дополнительный офис в Санкт-Петербурге, что стало началом развития ритейлового направления деятельности. В 2004 году на базе ОАО КБ «ПРОМАВТОБАНК» был создан новый филиал банка в Самаре. В 2007 году появился первый операционный офис в Тольятти. В 2008 году – филиал в Краснодаре, в 2010 году – филиал в Екатеринбурге. В 1 квартале 2015 г. банк сменил название на ПАО «БАЛТИНВЕСТБАНК».
23 декабря 2015 г. Банк России принял решение о финансовом оздоровлении ПАО «БАЛТИНВЕСТБАНК». Совместно с государственной корпорацией «Агентство по страхованию вкладов» (АСВ) был проведен отбор инвестора. По совокупности поступивших предложений от кандидатов и результатам оценки, проведенной АСВ, в качестве инвестора был выбран АКБ «Абсолют Банк» (ПАО), чей высокий уровень надежности и эффективности управления находит свое отражение в доверии со стороны государства в лице ЦБ и АСВ. Дополнительным преимуществом для ЦБ РФ и АСВ стал успешный опыт санации банка «КИТ Финанс», оздоровление которого досрочно завершили в 2014 году нынешние акционеры Абсолют Банка — НПФ «Благосостояние». 25 июня 2016 г состоялось общее годовое собрание Акционеров, по итогу которого Балтинвестбанк перешел под управление АКБ «Абсолют Банк» (ПАО). В настоящее время Балтинвестбанк осуществляет свою деятельность в обычном режиме, обеспечивая бесперебойное обслуживание клиентов.
По итогам мероприятий, предусмотренных Планом финансового оздоровления, Банк будет реорганизован путем присоединения к АКБ «Абсолют Банк» (ПАО).