De MBO Raad behartigt de gemeenschappelijke belangen van de aangesloten leden, biedt diensten aan en onderneemt gezamenlijke activiteiten die samenhangen met deze belangenbehartiging. De brancheorganisatie zet zich in voor 'Sterk onderwijs vandaag voor de beroepen van morgen'.
Het bestuur van de MBO Raad wordt gevormd door vertegenwoordigers uit het mbo-veld, Adnan Tekin is voorzitter van het bestuur. De voorzitters van colleges van bestuur en centrale directies van alle bij de MBO Raad aangesloten scholen vormen de algemene ledenvergadering. De dagelijkse leiding van het bureau van de MBO Raad ligt in handen van de directeur, bijgestaan door managers die leiding geven aan ongeveer 100 professionele medewerkers.