As suas raízes datam de Abril de 1979, na sequência da grande movimentação estudantil que se seguiu a 1962.
Atualmente, a AEFEP aposta num reforço do seu papel no seio da Faculdade e do meio universitário em geral, tendo sempre presente os interesses dos estudantes. Recentemente, tendo em conta esses objetivos, procurou-se uma clara melhoria dos serviços prestados (desde de serviços de reprografia e editorial ao serviço de bar) e um papel mais ativo na discussão de problemas estruturais que afetam a qualidade do ensino superior público.